１年点検に出したすぐ後にバイクのアイドリング時のエンジン回転数が下がって、たまにエンストします。勝手にエンジン回転数のつまみを回しても大丈夫ですか？それとも別に原因は考えられますか？バイク屋に持ってまた修理はだるいです。

点検後、不調になった場合その旨を点検したお店に申し出るのが正しいです。点検・整備内容が判らない以上は、コメントは出来ませーん。ここで質問する前に整備担当者に問い合わせしてみましょう。
ただ単にアイドリングが低いのであれば調整つまみで適切な回転に合わせるのは問題ありません。
車種が不明ですが一般的に1000〜1200rpmが適切です。